Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPHS2Q9NP85 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms