Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGAP3Q9NP61 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms