Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAT1LQ9HCJ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
VAT1LQ9HCJ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAT1LQ9HCJ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms