Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPJQ9HC77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CENPJQ9HC77 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPJQ9HC77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms