Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PARVBQ9HBI1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PARVBQ9HBI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms