Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S4

CAB39L, Calcium-binding protein 39-like, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39LQ9H9S4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAB39LQ9H9S4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAB39LQ9H9S4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAB39LQ9H9S4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms