Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPF2Q9H7B2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPF2Q9H7B2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPF2Q9H7B2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms