Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHX3Q9H6B9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHX3Q9H6B9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms