Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LINC00597Q9H2U6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00597Q9H2U6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00597Q9H2U6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms