Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOBPQ9H2D6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIOBPQ9H2D6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIOBPQ9H2D6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms