Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIL1Q9H173 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIL1Q9H173 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIL1Q9H173 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms