Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMG9Q9H0W8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMG9Q9H0W8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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