Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM117Q9H0C3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM117Q9H0C3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms