Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LSG1Q9H089 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LSG1Q9H089 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms