Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC22A4Q9H015 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC22A4Q9H015 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC22A4Q9H015 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms