Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTDSP1Q9GZU7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTDSP1Q9GZU7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms