Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLIRPQ9GZT3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLIRPQ9GZT3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms