Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
THSD7BQ9C0I4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
THSD7BQ9C0I4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
THSD7BQ9C0I4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms