Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ZC3H12CQ9C0D7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H12CQ9C0D7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZC3H12CQ9C0D7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms