Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM7Q9C029 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM7Q9C029 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM7Q9C029 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms