Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NLRP1Q9C000 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NLRP1Q9C000 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NLRP1Q9C000 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NLRP1Q9C000 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms