Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BARHL1Q9BZE3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BARHL1Q9BZE3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms