Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPL3Q9BY60 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPL3Q9BY60 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms