Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RNF17Q9BXT8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RNF17Q9BXT8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RNF17Q9BXT8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RNF17Q9BXT8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms