Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRRTQ9BXP5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRRTQ9BXP5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRRTQ9BXP5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms