Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LGR4Q9BXB1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGR4Q9BXB1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGR4Q9BXB1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms