Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SALL3Q9BXA9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SALL3Q9BXA9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms