Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFHD1Q9BUP0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFHD1Q9BUP0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms