Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CITED1Q99966 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED1Q99966 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED1Q99966 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms