Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL3Q99963 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SH3GL3Q99963 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms