Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP8Q99708 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms