Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CGREF1Q99674 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CGREF1Q99674 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms