Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SORT1Q99523 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORT1Q99523 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORT1Q99523 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms