Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPXM1Q96SM3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPXM1Q96SM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPXM1Q96SM3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms