Protein–RNA interactions for Protein: Q96RN5

MED15, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED15Q96RN5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED15Q96RN5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED15Q96RN5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED15Q96RN5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms