Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARXQ96QS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ARXQ96QS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ARXQ96QS3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms