Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC4A9Q96Q91 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC4A9Q96Q91 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms