Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CR12Q96Q35 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms