Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms