Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU8

QKI, Protein quaking, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKIQ96PU8 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.841e-7■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 NR3C1-211ENST00000504336 611 ntTSL 23.34□□□□□ -1.871e-7■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-12■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.164e-12■■■■■ 47.8
QKIQ96PU8 ST7-OT4-204ENST00000470996 416 ntTSL 22.81□□□□□ -1.964e-12■■■■■ 47.8
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QKIQ96PU8 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-11■■■■■ 47.8
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QKIQ96PU8 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 47.6
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QKIQ96PU8 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-9■■■■■ 47.6
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QKIQ96PU8 RBM28-202ENST00000415472 2251 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 47.1
QKIQ96PU8 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 47.1
QKIQ96PU8 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC8.14□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 47.1
QKIQ96PU8 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.18□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 47.1
QKIQ96PU8 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 47
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QKIQ96PU8 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.338e-13■■■■■ 47
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QKIQ96PU8 MBNL3-211ENST00000473364 780 ntTSL 34.52□□□□□ -1.695e-8■■■■■ 46.9
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