Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP3Q96P20 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NLRP3Q96P20 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NLRP3Q96P20 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms