Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC115Q96NT0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms