Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG3

TTC25, Tetratricopeptide repeat protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC25Q96NG3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC25Q96NG3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC25Q96NG3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms