Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC43Q96MW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC43Q96MW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC43Q96MW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms