Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01600Q96MT4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01600Q96MT4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms