Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.6
PCMTD1Q96MG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms