Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2orf48Q96LS8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf48Q96LS8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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