Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PHACTR3Q96KR7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PHACTR3Q96KR7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PHACTR3Q96KR7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms