Protein–RNA interactions for Protein: Q96KQ4

PPP1R13B, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R13BQ96KQ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R13BQ96KQ4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R13BQ96KQ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms