Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPGRIP1Q96KN7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPGRIP1Q96KN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPGRIP1Q96KN7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms